我校开设中医学专业卓越医师任继学班、制药工程专业卓越工程师班、中药学基础学科拔尖人才培养基地班等，培养学术型人才。大力推进医学类专业“3+2”“2.5+2.5”床边教学模式改革，护理学专业“2+1+1”教学改革，培养学生创新精神和实践能力。中医学专业获批教育部卓越医师（中医）教育培养计划试点专业，中药学获批吉林省基础学科拔尖人才培养基地。生物制药专业金赛定制班入选吉林省紧缺人才培养定制班培育项目。2020 年，开展“中药学拔尖创新人才培养计划”，创办中药学基础学科拔尖人才培养基地班，三年共选拔学生 117 人。
开展以医学人文教育为核心的通识教育。学校按照国家要求，开足开齐思政、体育、外语、计算机、心理健康、创新创业教育、国家安全教育等通识教育课程，并按国家要求纳入了人才培养方案。结合学校特点，出台《关于加强医学人文教育的实施意见》，开设医学伦理学、医学心理学、中国传统文化、医患沟通技巧等课程，面向非医学专业开设《现场急救常用技术》课程，实现人文课程与医学相互渗透，充分发挥通识课程在学生综合素质教育和能力培养中的作用。
开展以“杏林阳光体育计划”为载体的体育教育。在一年级开设必修课“太极拳+八段锦”，二年级开设专项课，三年级增设选修课（必选），四年级开展自主选修。
开展以课程教学、实践活动、校园文化、艺术展演“四位一体”的普及艺术教育推进机制，重点实施美育教学改革推进计划、美育教师打造计划、传统文化滋养传承计划、社会服务能力提升计划。建有艺术教育场地 12 个，开设美育课程20 门，丰富美育教育课程体系。学生修满美育课程 2 学分方可毕业。
成立劳动教育教研室，开设劳动教育课，构建日常生活劳动、志愿服务劳动和生产劳动“三级递进”的劳动教育模式。设置劳育必修课程 32 学时 1.5 学分。
我校通过打造示范课、开展专项课题研究、培育教师团队、出版教材读本、完善课程标准与教学设计等，构建了课程思政教学改革体系。课程思政教学研究中心为省级示范中心。
我校于 2018 年 1 月 3 日发布了《长春中医药大学建立实践学期实施方案》，至今已开展 6 期，参与人数达 5.2 万余人次。通过社会调查、专业实践、师承教育、知识技能专项培训、科学研究、创业实践等内容的实践活动，增强了学生社会认知、行业认知、专业认知，培养学生社会适应性与就业竞争力。
我校实施了自主学习、全程讨论、学生自由听课、多种考核的“主体性教育改革试点项目”。近三年，12 门课程参加试点，提高了学生自主学习能力。
我校自 2017 版人才培养方案实施指导性自学教学改革以来，坚持每门课程设置相应比例指导性自学学时，根据学习需求，自主设计学习目标、学习策略、学习方法，学生独立完成学习，更新了学生学习理念、优化学习方法、使学生学会如何学习，提高学习效率，逐步完善并形成良好的自主学习能力。
确立了“文化引领，课程驱动，实践历练，组织保障”的创新创业教育改革思路，创建了符合中医药院校办学特点的创新创业教育组织保障体系、课程培养体系、实践平台体系、文化引领体系。建立了由校党委书记和校长共同担任组长的创新创业教育领导小组，下设创新创业教学指导委员会，成立了创新创业学院。构建了“激发创意－启迪创新－促动创业”三创融合的实践服务平台和“实践课程化、活动项目化、考核学分化、竞赛激励化”四化运行的双创实践教育运行机制。
