学校始建于1950年的长春市中医进修学校。吉林省第二个“五年规划”对卫生事业的发展提出了新的要求，经过艰苦的第一次创业，1958年成立了长春中医学院， 原全国人大副委员长、中国科学院院长郭沫若为学校题写了校名。1962年吉林省卫生干部学校并入学院，1970年全国高等院校调整时期，学院并入了当时的吉林医科大学。1978年恢复了长春中医学院建制，完成了卓有成效的第二次创业。此后，学院逐步发展成为吉林省中医药教育、科研、医疗和对外交流的中心。2000年吉林省职工医科大学和长春中医学院附属卫生学校整建制地并入学院。进入新的世纪，学校着眼未来，立足长远发展，整合教育资源，不断扩大办学规模，提高办学质量和效益，开始了轰轰烈烈的把学校建成“中医药大学”的第三次创业。2002年学校建成了新校区；2003年成为了博士学位授权单位；2004年成为了省属重点高校；同年在全国有博士授权的一级学科水平评估中，主干学科中医学、中药学双双跻身10强；2006年经国家教育部批准将原长春中医学院更名为长春中医药大学。学校的事业蒸蒸日上，发展势头十分迅猛，提高了学校的综合实力，坚定了学校创建一流中医药大学的信心，把学校带进历史发展的新阶段。